Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICAQ29983 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms