Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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