Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEN1Q17RS7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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