Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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