Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDB1Q16531 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms