Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS72Q15906 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
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