Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN9AQ15858 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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