Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ALX1Q15699 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms