Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 NDUFA3-206ENST00000419113 654 ntTSL 318.13■□□□□ 0.496e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.446e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PLD3-217ENST00000594908 804 ntTSL 317.66■□□□□ 0.426e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PLD3-203ENST00000392032 873 ntTSL 517.32■□□□□ 0.366e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG13-227ENST00000622997 594 ntTSL 517.2■□□□□ 0.346e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PLD3-202ENST00000359274 745 ntTSL 316.84■□□□□ 0.296e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED16-215ENST00000621073 492 ntTSL 516.59■□□□□ 0.256e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 NCOR2-218ENST00000473999 1277 ntTSL 316.52■□□□□ 0.246e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.226e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.186e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PLD3-214ENST00000492243 710 ntTSL 216.02■□□□□ 0.166e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.146e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.136e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.076e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 HOXB2-202ENST00000504772 930 ntTSL 315.42■□□□□ 0.066e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TMED7-202ENST00000503010 805 ntTSL 215.33■□□□□ 0.046e-7■■■□□ 15.8
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PCBP1Q15365 TONSL-202ENST00000497613 6607 ntTSL 215.29■□□□□ 0.049e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PFDN1-206ENST00000514611 1139 ntTSL 214.78□□□□□ -0.046e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ZDHHC18-204ENST00000488397 1275 ntTSL 214.75□□□□□ -0.056e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.139e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.166e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.174e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TRAF4-209ENST00000473421 585 ntTSL 313.97□□□□□ -0.176e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.196e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED15-223ENST00000476187 593 ntTSL 413.87□□□□□ -0.196e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)13.84□□□□□ -0.196e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PI4KA-209ENST00000477245 3026 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.246e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PI4KA-207ENST00000466772 3109 ntTSL 213.42□□□□□ -0.266e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 SLC25A5-202ENST00000460013 775 ntTSL 313.4□□□□□ -0.266e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.286e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.296e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TMBIM6-222ENST00000550445 761 ntTSL 313.21□□□□□ -0.296e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.356e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PFDN1-201ENST00000261813 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.376e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 NDUFA3-208ENST00000422029 694 ntTSL 312.5□□□□□ -0.416e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TRAF4-206ENST00000454852 672 ntTSL 312.42□□□□□ -0.426e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.496e-7■■■□□ 15.8
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PCBP1Q15365 PFDN1-203ENST00000510217 1091 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.586e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 PI4KA-211ENST00000482030 655 ntTSL 211.28□□□□□ -0.66e-7■■■□□ 15.8
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PCBP1Q15365 ATP1B2-201ENST00000250111 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.846e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG13-225ENST00000621367 3893 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.896e-7■■■□□ 15.8
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PCBP1Q15365 ALG13-229ENST00000623148 3689 ntTSL 29.15□□□□□ -0.946e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TMBIM6-220ENST00000549966 538 ntTSL 59.09□□□□□ -0.956e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG13-228ENST00000623144 3693 ntTSL 29.05□□□□□ -0.966e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TMBIM6-211ENST00000548201 582 ntTSL 48.95□□□□□ -0.986e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.011e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG13-204ENST00000436609 3812 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.046e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 POGZ-212ENST00000485040 2741 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.041e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.061e-7■■■□□ 15.8
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PCBP1Q15365 TMBIM6-226ENST00000552635 574 ntTSL 47.85□□□□□ -1.156e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.186e-7■■■□□ 15.8
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PCBP1Q15365 ALG13-218ENST00000487141 745 ntTSL 57.03□□□□□ -1.286e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.291e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.396e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.41e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 TMBIM6-207ENST00000547013 428 ntTSL 26.21□□□□□ -1.426e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 POGZ-202ENST00000358476 6459 ntTSL 26.08□□□□□ -1.441e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG13-235ENST00000624881 876 ntTSL 55.27□□□□□ -1.576e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG13-239ENST00000636363 3480 ntTSL 55.16□□□□□ -1.586e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG13-234ENST00000624161 3761 ntTSL 25.06□□□□□ -1.66e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG13-209ENST00000470971 3200 ntTSL 53.21□□□□□ -1.96e-7■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 BAG6-246ENST00000438149 714 ntTSL 318.23■□□□□ 0.514e-8■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 BAG6-261ENST00000469182 653 ntTSL 310.55□□□□□ -0.724e-8■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 ALG3-203ENST00000414845 814 ntTSL 518.71■□□□□ 0.594e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.74e-8■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 519.9■□□□□ 0.782e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 DNM1-227ENST00000637999 1429 ntTSL 513.64□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 DNM1-207ENST00000482638 672 ntTSL 510□□□□□ -0.811e-6■■■□□ 15.8
PCBP1Q15365 MBOAT7-211ENST00000491216 564 ntTSL 219.27■□□□□ 0.683e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 MBOAT7-209ENST00000464098 493 ntTSL 215.7■□□□□ 0.13e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 MBOAT7-208ENST00000453320 557 ntTSL 414.68□□□□□ -0.063e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.542e-13■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-7■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.532e-7■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 KLHDC10-202ENST00000463413 503 ntTSL 228.54■■■□□ 2.162e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 KLHDC10-203ENST00000468226 772 ntTSL 38.02□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 PDIA4-203ENST00000466592 632 ntTSL 216.53■□□□□ 0.243e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-7■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 DTL-206ENST00000542077 4471 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.941e-7■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 DTL-202ENST00000463791 557 ntTSL 25.64□□□□□ -1.511e-7■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 DTL-203ENST00000475419 3662 ntTSL 25.29□□□□□ -1.561e-7■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 DTL-204ENST00000489149 815 ntTSL 25.13□□□□□ -1.591e-7■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 319.98■□□□□ 0.794e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.529e-8■■■□□ 15.7
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