Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK1Q15118 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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