Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PSME4Q14997 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME4Q14997 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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