Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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GBX1Q14549 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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GBX1Q14549 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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GBX1Q14549 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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GBX1Q14549 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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GBX1Q14549 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBX1Q14549 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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