Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms