Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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