Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms