Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOFQ13790 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOFQ13790 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOFQ13790 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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