Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALCAMQ13740 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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