Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FHL3Q13643 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms