Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF5Q13568 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF5Q13568 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms