Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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NAE1Q13564 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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NAE1Q13564 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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NAE1Q13564 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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