Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPM6BQ13491 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPM6BQ13491 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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