Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD4Q13485 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMAD4Q13485 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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