Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms