Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA4Q13156 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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