Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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