Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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TRAF1Q13077 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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