Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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