Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP3Q12983 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms