Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms