Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP1Q09161 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms