Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM27E3Q08E93 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms