Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms