Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms