Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms