Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2BQ02880 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms