Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APBA1Q02410 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APBA1Q02410 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms