Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms