Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms