Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms