Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTBN1Q01082 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms