Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms