Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRB1P82279 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRB1P82279 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB1P82279 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB1P82279 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB1P82279 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB1P82279 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB1P82279 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB1P82279 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB1P82279 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB1P82279 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB1P82279 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB1P82279 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB1P82279 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB1P82279 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB1P82279 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB1P82279 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms