Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRX1P78414 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms