Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IP78347 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms