Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCS1P62166 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCS1P62166 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCS1P62166 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCS1P62166 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCS1P62166 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms