Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VBP1P61758 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms