Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms