Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms