Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms