Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMDP57764 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMDP57764 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GSDMDP57764 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMDP57764 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMDP57764 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms